据C1观察，目前生物柴油产业在国内市场发展不甚理想，目前国内三大石油巨头除了中海油具有在海南省发展生物柴油的具体规划以外，另外两大公司中石化与中石油并未表现出具体发展生物柴油的意愿，彰显出国内生物柴油市场的重重困境。
而据C1了解，除了大型国有石油巨头以外，民营及外资资本在最近几年亦出现了投资国内生物柴油项目的意愿，然而结果同样令人失望。例如作为在纽约证券交易所上市的专门从事生物柴油生产的国内公司古杉集团，在其2010年8月发布的二季度财务报告中显示，2010年2季度古衫集团营业收入同比下滑64.8%，环比下跌16.6%至6020万元人民币，近几年盈利能力的下滑导致古杉集团不得不停产了上海以及福建的生物柴油装置以减少营运成本，控制亏损额度。
基于生物柴油今年来在市场上的表现，据C1分析，目前生物柴油的发展状况主要存在着以下几点的障碍。
首先，原料采集困难，难以形成原料搜集产业链以达成规模经济效应。
据了解，原料成本占据了生物柴油生产成本的75%左右。目前国内生物柴油的原料来源主要是废弃地沟油以及麻风树，菜籽等植物为
